Tata nilai Fakultas Agama Islam dan Prodi Pendidikan Agama Islam berpegang pada prinsip:
Al-muhafadhotu ‘ala qodimis sholih wal akhdzu bil jadidil ashlah.
Artinya:
Memelihara Nilai-nilai lama yang baik dan mengambil Nilai-nilai baru yang lebih baik.
Memelihara hal-hal yang lama yang baik : UPPS dan Prodi Pendidikan Agama Islam menjaga warisan yang dimiliki. Warisan itu meliputi akidah, yakni akidah ahlus sunnah wal jama’ah, dan cara berfikir ala NU (fikrah nahdliyah), yaitu cara berfikir moderat, dinamis, dan bermanhaj, serta amaliyah nahdliyah.
Membangun pemikiran Islam yang berbasis kultur Indonesia yang dipadukan dengan modernisasi, yakni dengan mengembangkan sejumlah pemahaman dan sikap yang ramah, santun, dan berbasis tradisi-tradisi Indonesia disatu sisi dan memahami modernitas zaman kekinian di sisi lain.
Mengambil hal-hal yang baru yang lebih baik: UPPS dan Program Studi Pendidikan Agma Islam Melakukan transformasi, terutama yang menyangkut Ilmu pengetahuan dan teknologi, yang yang pada saat ini menjadi penentu kemajuan dan daya saing.